Лекарственное применение мордовника связано с лечением такой группы болезней, как паралич, плексит, он действует возбуждающе на ЦНС и улучшает функции органов чувств, оказывает тонизирующее действие, помогает при головной боли, истощении. Он может оказывать двухстороннее воздействие на артериальное давление и применяется как при гипертонии, так и при гипотонии. Применяется мордовник при кожных болезнях, при болезнях легких, горла, носа, а также действует как потогонное и мочегонное (диуретическое). Отдельные части лекарственного растения применяют при инфекционном гепатите, эхинококке печени, перемежающейся лихорадке (корни), респираторных инфекциях, малярии, при головной боли, плеврите, гастроэнтеритах (соцветия), пневмонии — соцветия (в сборе). Плоды мордовника используются при астении, атрофии мышц; при параличе периферическом, при атрофии зрительного нерва. При эпилепсии применяется надземная часть растений — соцветия. Используются они и при болезнях кожи, болезнях печени, желчных протоков, как желчегонное, а при рвоте, нервно-психических болезнях и болезнях крови используются корни. Они же используются при раке пищевода, раке желудка, при остеомиелите. Семена мордовника применяются при очень серьезных нервных заболеваниях: парезах и параличах, плекситах, радикулитах и, а также рассеянном склерозе, миопатии, полиомелите, в лечении последствий инсульта, хронического лучевого воздействия.